توالي يابي بخشي از ژن فنيل آلانين آمونيالياز (pal2) دخيل درمسير سنتز آنتي اكسيدان ها و استفاده از آن در فيلوژني جنس هاي مهم زيرخانواده -Anthemideae

بومادران، درمنه، بابونه، داوودي و مخلصه از جمله مهم ترين جنس هايي زيرخانواده Anthemideae هستند كه به دليل داشتن تركيبات فلاونوئيدها و آنتي اكسيداني كاربردهاي قابل توجهي در داروسازي دارند. فلاونوئيدها تركيبات فنلي هستند كه جزو آنتي اكسيدان هاي غيرآنزيمي طبقه بندي مي شوند. فنيل آلانين آمونيا لياز (PAL) آنزيم كليدي در مسير سنتز فلاونوئيدها مي باشد. براي شناسايي و تعيين توالي ژن pal2 ابتدا براساس همرديف سازي چندتايي توالي هاي جستجو شده براي گياه مدل آرابيدوپسيس و ساير گياهان در پايگاه داده هاي بانك ژن (NCBI)، انجام شد. آغازگرهاي اختصاصي به صورت هرز براساس نواحي حفاظت شده در ناحيه ژني و همچنين ناحيه فعال دومين پروتئين PAL2 طراحي شد. آغازگرها در جنس هاي مذكور ناحيه اي به طول 700 جفت نوكلئوتيد را تكثير و سپس محصول PCR كلون و در ادامه تعيين توالي و در بانك ژن (NCBI) ثبت شدند. به منظور بررسي تنوع ژن pal2 بر اساس توالي نوكلئوتيد ها (جايگزيني هاي همجنس Transition و ناهمجنس Transversion نوكلئوتيد ها) در بين جنس هاي ذكر شده از نرم افزار Mega ver 5.0 استفاده و درصد تنوع محاسبه شد. نتايج بيوانفورماتيك بررسي تنوع نشان دادند جنس هاي مذكور از نظر ژن pal2 به خوبي حفاظت شده مي باشند و Matricaria sp. و Achillea sp. نزديكترين جنس ها به يكديگر و جنس هايArtemisia sp. و Chrysanthemum sp. دورترين جنس ها از يكديگر محسوب مي شوند.